摘要： 宏基因组学（metagenomic）又称环境基因组学（environmental genomics），指不依赖培养直接从微生物的天然环境中提取微生物基因的遗传物质，对微生物群体进行研究分析，最大限度地挖掘微生物资源。传统的微生物群落检测主要依靠培养，但是菌群的种类多，99.9%培养不成功，且不同的菌种生长的条件和速度不一，导致无法真实还原微生物的原始状态［1］。宏基因组学研究与传统微生物研究方式的最大区别在于把微生物看成一个整体，摆脱了对单个微生物培养和分离的步骤，直接对环境中所有的微生物进行研究，进而可以全面地对所有微生物进行分析。它包括以下4个步骤：提取某一环境样品所有微生物的基因组DNA；直接测序探究环境中微生物的群落结构和功能；构建宏基因组文库；对文库进行筛选寻找和发现新的功能基因及活性代谢产物。目前宏基因组学技术在各个领域应用较为广泛，比如环境保护（气候、水处理、极端环境、海洋资源）、石油污染修复、生物冶金等领域已经取得了引人瞩目的成果……